代试管孩子和一代试管出生的孩子都一样健康，根据临床中妊娠病例的比较调查发现，一代试管和二代试管新生儿的结局并没有出现太大的差异，两种试管技术出生的孩子都非常的健康，并且两种试管方式都不会增加流产或者是出现新生儿畸形的风险，现在辅助生殖技术目的就是帮助不 孕患者优生优育。
第二代试管婴儿流程与第一代试管婴儿手术的操作流程基本一致，都需要经过促排卵、取卵和取精、胚胎培养、胚胎移植、移植后14天验孕等环节。二者的主要区别是第二代试管婴儿助孕过程中，在男性的精子取出后进行优化处理，挑选出形态好、活力佳的单个精子，直接注入到卵母细胞内，帮助其完成受精。
第一代试管婴儿适用于女性不孕症，在采集女方卵子以后直接在体外通过自然受精的方式让精子和卵子受精然后培养胚胎。而二代试管婴儿更适合男性不育症的治疗，优选男方的精子通过显微镜下直接注入卵母细胞内达到受精的目的。
试管婴儿本身不会对孩子的健康造成影响，孕妇本身的习惯才会对孩子的健康造成严重的影响，如果孕妇在孕期有抽烟喝酒，熬夜等等不良的习惯，会对严重的影响到胎儿的健康，例如造成胎儿发育迟缓、胎儿发育畸形，孕后期流产的概率也会大大增加。
